La misión del IIS Biogipuzkoa es ser el centro de I+D+i de referencia del Sistema Sanitario Público en Gipuzkoa. Para ello, lidera el desarrollo de actividades científicas e innovadoras de excelencia de carácter traslacional e impacto en la salud de la población.
Genera sinergias con su entorno empresarial que permiten afrontar proyectos de valor añadido cuyos resultados revierten en las y los pacientes y la sociedad.