Joseba Elizazu Perez / Edurne Zapirain Etxebeste & Raquel Plata Redondo

Salón de actos

17/05/24

13:30

Identification of novel drivers of prognosis and metastasis in gastric cancer

Gastric Cancer (GC) presents poor outcome due to the high incidence of recurrence and metastasis. Patients with advanced disease display a life expectancy of only 8 months, being the mechanisms underlying GC progression poorly understood.

In this work, we developed two complementary strategies to identify novel driver genes of GC malignancy, taking advantage of bioinformatic analysis and data from several public available datasets.

On the one hand, we explored the overlapping genes between the top-100 genes most associated with overall and disease free survival in GC, identifying 5 novel genes  (ANKRD6, ITIH3, SORCS3, NPY1R and CCDC178). We confirmed that the high expression of the five genes individually and as a signature was associated with poor prognosis and recurrence in over 2000 GC cases obtained from the integration of several cohorts using our own analysis pipeline. Moreover, the expression of ANKRD6 and ITIH3 was significantly higher in metastasis and their levels associated to Epithelial to Mesenchymal Transition and stemness. Accordingly, functional studies and RNAseq analysis in ANKRD6-silenced GC cells revealed a novel pro-metastatic role of ANKRD6 in the disease.

On the other hand, we identified the genes commonly upregulated in GC patients presenting (i) metastasis (ii) recurrence and (iii) relapse after treatment. In this manner, we identified two genes (RTL1 and CGB5) linked to GC malignancy. Through additional bioinformatics and functional assays, we have uncovered an oncogenic role for these genes in GC.

In summary, we have identified and validated the impact of novel genes in cancer progression and malignancy.


 Atención perinatal en la Red de Salud Mental de Gipuzkoa. Programas Amatasuna: detección y abordaje precoz de la patología mental perinatal y Koxkortzen: detección de señales de alarma en bebés de madres con patología mental.

La patología mental materna es un problema de salud pública que puede afectar gravemente el bienestar de la madre y del bebé, siendo la depresión y la ansiedad los diagnósticos más investigados. Los estudios de revisión muestran prevalencias entre 10-20%, aumentando a un 40-50% de recaída depresiva en mujeres con historia previa.  En este contexto surgen los programas Amatasuna y Koxkortzen. Amatasuna, enfocado en la detección temprana y el tratamiento precoz de la patología mental perinatal en las mujeres guipuzcoanas atendidas en el control de embarazo y puerperio hasta el primer año de vida del bebé. Y Koxkortzen, iniciado como extensión del programa Amatasuna, en la detección y evaluación de señales de riesgo en bebés nacidos de madres con patología mental, utilizando protocolos de screening y evaluación durante los primeros dos años de vida. En este seminario se describirá el proceso de diseño de los programas, los resultados preliminares de su pilotaje y el plan de despliegue previsto.