Zahartzea arrisku-faktore garrantzitsua da gaixotasun neurodegeneratiboetarako, hala nola Alzheimerrerako, Parkinsonerako eta alboko esklerosi amiotrofikorako (AEA). Gero eta ikerketa gehiagok iradokitzen dute ezegonkortasun genomikoa eta alterazio epigenetikoak funtsezkoak direla prozesu horietan.

Biologia Konputazionaleko eta Sistemen Biomedikuntzako Ikerketa Taldeko ikertzaileek — Marcos J. Araúzo-Bravo eta Daniela Gerovska —, Jenako Unibertsitate Ospitalearekin (Alemania) lankidetzan, liburu-kapitulu bat argitaratu dute: “DNA zirkular estrakromosomikoaren mekanismo genetiko-epigenetikoak: zahartzeari eta neurodegenerazioari buruzko ikuspegi berri bat“, RNAren teknologiei buruzko Springerren liburu-sortaren baitan, Zahartzea eta neurodegenerazioa deskodetzen.

Kapitulu honek DNA zirkular estrakromosomikoak (DNAec) — kromosometatik kanpo dauden DNA zirkularraren zatiak — nerbio-sistema zentraleko dinamika genomiko eta epigenomikoaren erregulatzaile berri gisa duen garrantzia aztertzen du. Lehen, DNAri egindako kaltearen azpiproduktu soiltzat hartzen ziren, baina orain DNAec-ak aintzat hartzen dira adierazpen genikoan, kromatinaren arkitekturan eta egonkortasun genomikoan eragiteko duten gaitasunagatik.

Egileek DNAec-aren kategorizazioaren, egiturazko aniztasunaren eta mekanismo molekularren ikuspegi orokor osoa eskaintzen dute, mutazio somatikoetan, kontrol epigenetikoan eta zahartzearekin lotutako narriadura neuronalean duen eginkizuna nabarmenduz. Ikuspegi konputazional berri bat ere sartzen dute, Sortutako Zirkuluak Geneko (PpGC), ADNec-en sekuentziak mapatzeko eta adinaren mendeko sinadura genomikoak erakusteko.

Aurkikuntza horiek estrategia diagnostiko berritzaileei ateak irekitzen dizkiete, biopsia likidoetan DNAec askea erabil baitaiteke nahasmendu neurodegeneratiboen monitorizazio ez-inbaditzailerako. EccDNA gertaera ez-konbentzionalen erregulatzaile gisa kokatzean, zahartzeari, NSZren patologiari eta biomarkatzaileen aurkikuntzari buruzko ikerketa-norabide berrietarako agertokia prestatzen du kapitulu honek.

 

Araúzo-Bravo MJ, Gerovska D, Schwab M, Kretz A. Chapter: Genetic-Epigenetic Regulatory Mechanisms of Extrachromosomal Circular DNA: A New Perspective on Aging and Neurodegeneration in book (editor Jan Barciszewski): Decoding Aging and Neurodegeneration The Role of Nucleic Acid Epigenetics (pp.265-313) DOI:10.1007/978-3-031-91072-2_12