Alex Martinez Ascensionek beka bat jaso du Eusko Jaurlaritzatik Cambridgeko Unibertsitatean (Erresuma Batua) bere ikerketa-karrera jarrai dezan eta Institutura itzul dadin bere ikerketa-ildoa garatzeko bertan lortuko duen ezagutzarekin. Beregana jo dugu egingo duen lanari buruz gehiago jakiteko
Doktoretza osteko laguntza hau lortzera eraman zaituen zure ibilbideaz zer nabarmenduko zenuke?
Zientziarekin harremana biokimikatik hasi banuen ere, laster konturatu nintzen pipeta eta bata lana ez zela niretzat. Gehiago gustatzen zitzaidan programatzea, beraz, bioinformatikara hurbildu nintzen, eta ia 10 urte daramatzat mundu honetan (Gradu Amaierako Lanetik, urrutira joan gabe).
Bioinformatika asko gustatzen zait biologia ulertzeko tresna gisa, nire buruan esperimentuak sortzeko eta ordenagailu batekin nahiko erraz lurreratzeko aukera ematen baitit, etxetik, Biogipuzkoatik edo beste edozein lekutatik. Gainera, laguntza hori lortzeko balio izan didaten trebetasunak eman dizkit. Adibidez, gaur egun aztertzen ditugun datu asko konplexuak edo izugarriak dira (Exceleko taula batek jasaten duena baino askoz gehiago), beraz, begirada analitiko bat prestatu behar duzu datuek ezkutatzen dituzten eta begi hutsez ikusten ez diren angelu hilak aurkitzeko. Gainera, bioinformatika estatistikarekin batera doa lastoa eta alea bereizten jakiteko emaitzak lortzen ditudan bakoitzean, eta datuetan gertatzen ari denari buruzko azalpen bat eman behar dut. Orduan, estatistika analisi-gaitasunari gehituz, nire esperimentuak sortzeko eta pipeta-zientifikoekin lankidetzan aritzeko ezinbestekoa den tresna-kutxa batekin amaitzen dut, askotan galdera eta bertara iristeko tresnak baitituzte, eta bioinformatikatik bidea sortzen diegu.
Bioinformatikari gisa egin dudan ibilbidean, datu oso ahaltsuetan espezializatu naiz, eta gero eta gehiago erabiltzen dena biomedikuntzan: zelula bakarraren RNAren sekuentziazioa (scRNAseq). Modu errazean esanda, teknika honek zelulak ehun batetik “banan-banan” bereiztea eta zelula bakoitzean zein gene dauden aktibo ikustea ahalbidetzen du, une horretan duten egoera eta funtzioa irakurriko bagenu bezala. Horri esker, lehen oharkabean pasatzen ziren zelula-mota asko aurkitu dira, eta hainbat gaixotasunetan zer zelula aldatzen edo desagertzen diren ere zehatz ikus daiteke. Ikerketari dagokionez, teknika hau oso baliagarria da ehun edo organo baten atzean dagoen funtsezko biologia azaltzeko, bai eta diagnostiko mailan garrantzitsuak diren markatzaileak aurkitzeko ere. Nire ibilbidean scRNAseq datu batzuk aztertu ditut. Nire tesian, fibroblastoak izeneko azaleko zelula batzuen arteko desberdintasunak aztertzen hasi nintzen, baina muskulu-datuak ere aztertu ditut, eta, orain, doktore osteko nire etapan, garuneko eta nerbio-sistemako zeluletan espezializatzen ari naiz.
Esperientzia horri esker, horrelako datuak ahalik eta gehien estutzen dituen proiektu bat diseinatu ahal izan dut, eta, neurri batean, laguntza zergatik lortu dudan azaltzen du. Nire proposamenaren puntu interesgarrienetako bat da ez dudala datu berririk sortuko, baizik eta argitaratutako dozenaka ikerketa bildu eta bateratuko ditudala. Horrek pazientzia handia eta teknika espezifikoak eskatzen ditu azterlan desberdinei buruzko informazioa biltzeko, baina azterketa bakar batekin lortu ezin den ikuspegi bakarra ematen du, ebaluazioan oso ondo baloratu dena.
Zein ikerketa-ildotan lan egingo duzu? Non egingo duzu lan horren zati bat Euskadira ezagutza horrekin itzuli aurretik?
Azken 3 urte hauetan neuroendekapenezko gaixotasunen esparruan lan egiten aritu naiz, bereziki Alboko Esklerosi Amiotrofikoan (AEA) eta Esklerosi Anizkoitzean (EA). Gaixotasun hauetaz liluratzen nauen zerbait sexuaren arabera (gizonen eta emakumeen artean) desberdintasun argiak dituztela da. Adibidez, EA ohikoagoa da emakumeen artean, eta neuroendekapenezko gaixotasun askotan sintomak eta bilakaera aldatu egin daitezke sexuaren arabera. Oraindik ulertzeko asko falta zaigun arren, pixkanaka aurrera egiten ari da aldagai hori ikerketan sartzeko, eta, horri esker, badakigu zenbait farmako eraginkorragoak izan daitezkeela sexu jakin batentzat, edo hormona-terapiak ere aztertzen ari dira gaixotasun horien aurrerapena atzeratzeko. Gainera, ikusten ari da hormona horiek paper garrantzitsua dutela nerbio-sisteman, eta menopausiaren eta andropausiaren ondoren, babes-efektu horren zati bat murriztu egin daitekeela, eta horrek eragina izan dezakeela patologia horien arriskuan edo garapenean. Hala ere, zergatik garatzen dituzte pertsona batzuek gaixotasun horiek eta beste batzuek ez?
Galdera hau ikerketa-talde askoren elkarlanarekin bakarrik erantzun daitekeen arren, nire ildoarekin nire hondar-alea emango dut. Horretarako, nire ikerketa-ildoa hormonetatik harago doa, eta genoman zentratuko naiz, lupa bat jarriz X eta Y. kromosoma sexual ospetsuetan. Gainerako kromosomek ez bezala, bi kromosomek berezko berezitasunak dituzte. Ba al zenekien, adibidez, X eta Y kromosomek oso berezi bihurtzen dituzten eskualde berdin-berdinak dituztela; XX pertsonengan kromosometako bat inaktibatu egiten dela, baina zati batzuek aktibo jarraitzen dutela; edo XY pertsonengan Y kromosoma adinarekin galtzen dela, eta galera hori hainbat gaixotasunekin erlazionatu dela? Nire proiektuan fenomeno horiek ohikoak diren neurtuko dut, eta zelula motaren arabera modu desberdinetan gertatzen diren (ikerketa batzuk hasi dira ikusten baietz). Horretarako, scRNAseq erabiliko dut, fenomeno horiek desberdinak diren ikusteko, ez soilik zelula-mota desberdinen artean, baita mota bereko zelula bakoitzaren eta azterketen artean ere.
Nire ikerketa-lerroa aurrera eramateko, bi urtez Cambridgeko Unibertsitateko Mina Ryten irakaslearen laborategira joango naiz. Minaren taldea neuroendekapenezko gaixotasunak aztertzen espezializatuta dago, Parkinsonen gaixotasunean arreta gehiago jarriz, bai genetikan bai bioinformatikan. Cambridgen ikasiko dut zer metodo erabiltzen dituzten analisi batzuetarako, nire ikerketarako erabil ditzakedanak. Horiek hobetu ondoren, itzuli eta nire ikerketarekin jarraitu ahal izango dut AEAn espezializatutako Francisco Gil Bearen laborategian, laguntzaren hurrengo hiru urteetan.
Zer sentitzen duzu horrelako errekonozimendua jasotzean?
Jaso nuenean sentipen-mataza bat sentitu nuen, eta oraindik askatzen ari naizeba. Alde batetik, oso pozik nago ikerketa-urte guztiek fruituak eman dituztelako, eta laguntza honi esker, lehen aldiz has naiteke nik erabat diseinatutako eta harro nagoen proiektu batekin.
Aukera sinestezin gisa ere bizi dut bi urte igarotzea beste herrialde batean, munduko unibertsitate ospetsuenetako batean eta zientzia kolaboratiboa eta kalitate-estandar oso altuak lehenesten dituen ikerketa-talde batean. Nire egunerokoan dauden bi balio dira nire ikerketan.
Baina sakrifizio bat ere bada, urte hauetan eraiki ditudan eta nagoen lekuan egoteko hainbeste zaindu eta eutsi nauten lotura guztietatik aldentzea. Badakit bi urte hauek esperientzia eta konexio garrantzitsuak sortzeko aukera bat direla, baina aldaketa handia da. Izan ere, akademiak, beste hainbat sistemak bezala, igaro beharreko uztaiak ditu atzean hainbeste pertsona uzten dituen piramide horretan gora egiteko, eta hau horietako bat da.
Hala ere, eskertzen dut Eusko Jaurlaritza bezalako erakunde publiko batek, nire unibertsitate-ikasketak nahiz 4 urteko doktoratu aurreko kontratua finantzatu dituenak, nigan konfiantza izaten jarraitu izana kalitatezko zientzia bat egiteko. Babes hori itzultzea espero dut, ezagutza zientifikoan lagunduko duten emaitzekin, eta, bereziki, neuroendekapenean sexuarekin eta generoarekin lotutako aniztasunean lagunduko duten emaitzekin, oraindik asko aurkitzeko dagoen alorrean, hain zuzen ere.
