Formando parte del Instituto Biogipuzkoa desde su origen, esta Área lidera el estudio de la patología infecciosa, desde la epidemiologia de las enfermedades transmisibles a los ensayos clínicos con nuevos agentes antimicrobianos, pasando por patologías infecciosas tan relevantes como la endocarditis infecciosa, las enfermedades de trasmisión sexual o la resistencia antimicrobiana.
También focaliza su interés en los cambios recientes que se han producido en las enfermedades infecciosas, como la pandemia del SARS-CoV-2, la cronificación del VIH, la irrupción de virus emergentes y la aplicación de nuevas técnicas moleculares al estudio de mundo microbiano (metagenómica, WGS).